在 Linux 操作系统上运行 GNU R

GNU R 可以通过多种方式在 Linux 操作系统上运行。在本文中，我们将描述从命令行、应用程序窗口、批处理模式以及 bash 脚本运行 R。

您将看到在 Linux 中运行 R 的这些不同选项适合特定任务。其中一些更适合可以在一行代码中完成的简单统计分析，另一些更适合需要执行大量 R 表达式的更复杂的程序。

最后，我们可能想要运行一个需要一两天才能在 Linux 集群上运行的程序。在本例中，我们将在后台运行 R，这允许我们从集群中注销。

在本教程中您将学习：

• 如何在主要 Linux 发行版上安装 R

• 如何从 Linux 命令行运行 R

• 如何在应用程序窗口中运行 R

• 如何以批处理模式运行 R

• 如何从 Linux Bash 脚本运行 R

如何在主要 Linux 发行版上安装 R

您可以使用下面适当的命令通过系统的包管理器安装 GNU R。

要在 Ubuntu、Debian 和 Linux Mint 上安装 GNU R：

$ sudo apt install r-cran-littler

要在 Fedora、CentOS、AlmaLinux 和 Red Hat 上安装 GNU R：

$ sudo dnf install R

要在 Arch Linux 和 Manjaro 上安装 GNU R：

$ sudo pacman -S r

从 Linux 命令行运行 R

也许，在 Linux 下运行 R 最简单的方法是从 Linux 命令行运行它。简单地像这样：

$ R

此命令的结果是，将出现一个 R 提示符，您可以在其中输入更多命令。它看起来是这样的：

上面显示了您的 Linux 平台上安装的 R 版本。它还提供了一些内置命令来帮助您。我们不会进一步详细说明这些帮助命令，因为我们将在后面的文章中处理它们。目前，我们想指出，为了退出 R，我们只需输入：

> q()

这将为我们提供保存工作区图像的附加选项：

Save workspace image? [y/n/c]: 

这种启动 R 的方式更适合较短的统计分析，不涉及执行大量 R 命令。

在 Linux 下的应用程序窗口中运行 R

Linux 下 R 的应用程序窗口类似于其他平台上使用的图形用户界面。键入以下内容以在应用程序窗口中启动 R：

$ R -g Tk &

下图是Linux下的这样的窗口。

tk-R 应用程序窗口中的菜单为您提供了一些选项。这些是安装和加载包以及从文件中获取源代码。它还包括一些演示示例以及 R 帮助的访问。基本上，我们在上图中看到的就是R控制台。

应用程序窗口缺少在其他平台上看到的工具栏。但是，R 控制台本身允许您键入表达式（命令），然后由 R 系统解释这些表达式，并将响应输出到屏幕上。应用程序窗口类似于在 Linux 命令行中运行 R。

与以前类似，我们不会在应用程序窗口中运行大量命令。以下两种运行 R 的方法允许我们进行更复杂的实现。

在 Linux 中以批处理模式运行 R

在 Linux 中以批处理模式运行 R 提供了一种按顺序执行大量命令并将结果保存到文件的方法。现在让我们在 R 中创建第一个函数并将其保存在名为 r-example-function-1.R 的文件中。此函数将从文件加载一些数据，然后对数据应用指数函数并将输出保存在相应的文件中。

1. 第一步生成 r-example-function-1.R 文件，其中包括：

   
   r_example_function_1<-function()
   {
   data<-read.csv("gnu-r-example.csv",header=F)
   expdata<-exp(data[,1])
   write.csv(expdata,"output_gnu-r-example.csv")
   }
   r_example_function_1()
   

   还将 gnu-r-example.csv 下载到您的工作目录。

2. 您现在可以在 bash 模式下运行文件 r-example-function-1.R 中包含的命令，如下所示：

   
   $ R CMD BATCH r-example-function-1.R
   

   这将生成一个名为 r-example-function-1.Rout 的输出文件和由函数 r_example_function_1 生成的文件 output_gnu-r-example.csv() 在 r-example-function-1.R 文件中定义。

3. 有关从 Linux 命令行运行 R 的更多信息（包括可用选项），请键入：

   
   $ R --help
   

在 Linux 中从 bash 脚本运行 R

在 Linux 中从 bash 脚本运行 R 需要编写包含 R 函数的 bash 脚本，然后调用这些函数。例如，创建一个名为 r-bash-example.sh 的文件，如下所示。

1. 首先，创建包含以下内容的 r-bash-example.sh： <前> #!/bin/bash R --no-save <

2. 现在，使该文件可执行

   
   $ chmod +x r-bash-example.sh
   

3. 要运行此文件类型中包含的 R 函数：

   
   $ ./r-bash-example.sh 
   

4. 请注意，还可以通过以下方式在后台执行此类脚本，例如在 Linux 集群上：

   
   $ nohup ./r-bash-example.sh &
   

   这允许您注销集群并使程序保持运行。请注意，这还将生成一个 R 输出文件：nohup.out。

结束语

本文仅触及运行 R 的可能性的表面。例如，R 可以与 Java 等其他编程语言集成。此外，R 软件获得的分析可以集成到 Web 应用程序中。

GNU R 教程系列

第一部分：GNU R 入门教程：

1. Linux 操作系统上的 GNU R 简介

2. 在 Linux 操作系统上运行 GNU R

3. 关于基本操作、函数和数据结构的 GNU R 快速教程

4. 统计模型和图形的 GNU R 快速教程

5. 如何在 GNU R 中安装和使用软件包

6. 在 GNU R 中构建基本包

第二部分：GNU R 语言：

1. GNU R 编程语言概述